1、种类区别，巴旦木是桃属中扁桃亚属的植物；而杏仁属于蔷薇科植物。

2、形状区别，杏仁果为扁平卵形，一端圆，另一端尖；巴旦木的果实呈扁而长，好似椭圆的形状。

3、果壳的坚硬程度区别，杏仁果果壳较硬，不易剥开；巴旦木的果壳很薄，用指甲盖就能抠开。

4、气味区别，巴旦木的果实有特殊的甜香风味；杏仁的气味芳香微苦。